揭秘尖端诊断测试:解码DNA查明感染病因

一项先进的诊断测试利用基因测序技术,检测可能引起疾病的一系列病原体,包括病毒、细菌、真菌和寄生虫。

一项新研究发现,该测试在识别脑膜炎等神经感染病因方面非常有效。

该测试目前尚未得到 FDA 批准,且费用昂贵,但其创造者希望未来能得到更广泛的应用。

革命性的诊断测试

周二发表的两项研究表明,一种尖端的诊断测试通过分析 DNA 和 RNA 来检测广泛的病毒、细菌、真菌和寄生虫,帮助一些医生为医学疑难杂症找到了诊断结果。

传统的诊断测试通常旨在测量特定的物质,例如蛋白质、激素或微量的遗传物质。但是,由加利福尼亚大学旧金山分校开发的基因组测试却提取了血液、组织或体液样本中存在的所有 DNA 和 RNA,然后对这些遗传物质进行测序。它将这些序列与庞大的病原体数据库进行比较,以查看哪些序列匹配。

该技术不会取代用于诊断常见疾病的现有测试(例如针对新冠病毒或链球菌性咽喉炎的测试),因为它提供结果的速度较慢且费用更高。但它在特定情况下显示了前景:当患者在医院出现严重症状,但最初的测试结果呈阴性,且医生无法弄清楚病因时。

据周二发表于《自然医学》杂志的一项新研究称,该测试已经有效识别出神经感染(如脑膜炎和脑炎(脑或脑周围膜肿胀))的病因。通过使用脊髓液样本,它能够诊断出 UCSF 在大约七年时间里收集的 4,800 多个样本中的 86% 的神经感染。

2021 年和 2022 年,该测试能将移植受者中脑炎病例与他们器官捐赠者中的黄热病联系起来。并且去年,它帮助查明了在墨西哥接受手术患者中脑膜炎爆发的病因。

UCSF 实验室医学和传染病教授兼新研究的资深作者查尔斯·邱博士说:“我们的测试被用来确定该病因的一种特定真菌——镰刀菌,这是其中一名早期的发病患者身上的。”

周二发表于《自然通讯》杂志上的该测试的第二项研究表明,它还可以用于检测新型病毒,包括那些有可能引发大流行的病毒。研究人员进行了一项模拟,以了解该测试是否能够检测到人类病毒,例如导致新冠病毒的冠状病毒,即使研究人员从测试所依赖的数据库中删除了这些病毒的基因序列。

邱说,该测试仍然可以根据动物的相关毒株识别出这些病毒。

美国食品药品监督管理局已授予该测试“突破性设备”称号,这允许实验室根据其帮助患者的潜力使用该测试,尽管该机构尚未批准该测试。但该测试的费用很高:它的费用每份样本 3,000 美元,而不到 10 个实验室常规使用它,邱说。

他说:“传统上,它被用作最后的手段进行测试,但这主要是因为存在一些问题,例如测试费用、它只能在专门的参考实验室中进行,并且它的运行也相当费力。”

邱补充说,新研究“提出了这样一种可能性,即我们也许应该考虑在感染过程中尽早进行这项测试”。

邱和他的 UCSF 研究员在 10 年前开发了该测试。在那之后不久,它检测到了一名处于医学上诱导昏迷的 14 岁男孩中的钩端螺旋体病细菌感染病例。该诊断结果促使医生开出青霉素,此后这名男孩迅速康复。

但是,南加州大学临床病理学副教授苏珊·巴特勒-武表示,该测试也存在一些限制。

她说,这项技术对于普通的社区医院来说在可预见的未来来说可能过于复杂而无法采用。并且医生可能难以解释结果,因此他们需要咨询具有适当专业知识的实验室主任。

巴特勒-武说:“除非有人将其商业化并放入一个带有易用按钮的盒子中,否则这并不是临床实验室会做的事情。”

她补充说,该测试也会遗漏一些病例,因此应该与医院中的其他诊断测试一起使用。

巴特勒-武说:“它不是一站式服务。” “它只会作为一种辅助工具。”

尽管如此,邱表示,他可以想象有一天该测试将在医院中广泛用于诊断各种疾病,例如肺炎或脓毒症的根源。

他说:“我们需要降低成本,还需要缩短周转时间。”

原创文章,作者:星阁,如若转载,请注明出处:http://www.xgrl.net/n/202411131046044996.shtml

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